福建生物工程职业技术学院是一所国家公办全日制高等职业院校，被誉为海西生物医药高素质技能型人才的摇篮，现有各类在校生5000多人。2011年1月通过高等职业院校人才培养工作评估。学院地处福州市区，现有洪山桥和齐安两个校区，占地150多亩，环境优美、交通便捷，学习、生活设施配套齐全，新校区占地306亩，位于福州市五四北，正在建设中。
学院开设7个专业（另两个专业方向），其中生物制药技术、中药、药品经营与管理等3个专业被评为省级精品专业，中药、保健品开发与管理专业获批国家“支持高等职业学校提升专业服务能力”项目。学院师资力量雄厚，现有专任教师218人，其中博士、硕士占38%。高级职称占35%，“双师型”占61.54%。
学院教学实验实训设施完善，建有35个专业实验室，其中生物食品发酵设备居全国同类院校领先水平；建有药品生产GMP教学实验厂、食品保健品调制实验厂、中药饮片加工实验厂，品种齐全的中药标本馆、生物制药实训中心（获评2009年省级财政支持建设项目）、保健品研发中心、武夷山齐云峰自然博物园实训基地；拥有分布于全省各地的10家省市药检所实训基地，与150多家生物医药、保健食品企事业单位开展深度合作，共同培养高职人才，实现校企双赢。
学院先后与台湾中国医药大学、嘉南药理科技大学等10所高校开展教学科研学术交流，与台湾中州科技大学签订合作办学协议；学院与福建中医药大学、福建农林大学、沈阳药科大学等高校联办本科函授学历教育和生物工程、中草药专业硕士研究生学历教育，被确定为国家教育体制改革试点项目“高、中职业院校联合培养药学技能人才改革试点”的牵头单位，形成了较为完善的普通教育与继续教育相衔接、中高职互通的“立交桥”教育体系。
学院开辟了贫困生入学“绿色通道”，建立了以国家助学贷款为主渠道，以国家奖学金、国家励志奖学金、政府奖学金、政府助学金、勤工助学活动为补充的较为完善的助学体系，确保不让一个学生因家庭经济贫困而辍学。学院设有国家职业技能鉴定站，连续7年被评为福建省职业技能鉴定工作优秀单位。
学院坚持以“培养生物医药人才，服务海西经济建设”为宗旨，以合作办学、合作就业为主线，积极探索校企合作、订单培养高职人才培养模式的创新改革。历届毕业生“专升本”升学率近10%，毕业生就业前景好，就业率连续多年保持在98%以上，位列全省高职高专院校前茅。历年来已培养中、高级专门人才两万多名，一大批已成为福建生物医药工商业的精英骨干。
